Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOP08100 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOP08100 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms