Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F13BP05160 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F13BP05160 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
F13BP05160 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms