Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR1AO95602 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR1AO95602 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms