Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DENRO43583 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DENRO43583 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DENRO43583 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms