Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HHLA1C9JL84 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HHLA1C9JL84 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA1C9JL84 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA1C9JL84 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA1C9JL84 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA1C9JL84 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA1C9JL84 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA1C9JL84 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA1C9JL84 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA1C9JL84 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA1C9JL84 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HHLA1C9JL84 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HHLA1C9JL84 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms