Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM247A6NEH6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM247A6NEH6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms