Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX9Q9Y5X1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SNX9Q9Y5X1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX9Q9Y5X1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms