Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAI2Q9Y5P3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms