Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGB5Q9Y5G0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB5Q9Y5G0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB5Q9Y5G0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms