Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRRAPQ9Y4A5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRRAPQ9Y4A5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms