Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAB1Q9Y478 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB1Q9Y478 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB1Q9Y478 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms