Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2J1Q9Y385 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2J1Q9Y385 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms