Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG3Q9Y2Y8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms