Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED16Q9Y2X0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED16Q9Y2X0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms