Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BTRCQ9Y297 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BTRCQ9Y297 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms