Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2BQ9Y287 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITM2BQ9Y287 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITM2BQ9Y287 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms