Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERGIC3Q9Y282 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERGIC3Q9Y282 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms