Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF13BQ9Y275 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms