Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNNQ9UQP3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNNQ9UQP3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNNQ9UQP3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms