Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH4Q9UQ05 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH4Q9UQ05 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms