Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AGTPBP1Q9UPW5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms