Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.77■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
TRAK1Q9UPV9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TRAK1Q9UPV9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRAK1Q9UPV9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.5 ms