Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRPK3Q9UPE1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPK3Q9UPE1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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