Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FZD1Q9UP38 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FZD1Q9UP38 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FZD1Q9UP38 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FZD1Q9UP38 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FZD1Q9UP38 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FZD1Q9UP38 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FZD1Q9UP38 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms