Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHA4Q9UN74 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHA4Q9UN74 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PCDHA4Q9UN74 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms