Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML1Q9UN30 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCML1Q9UN30 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCML1Q9UN30 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms