Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF19Q9UMS4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF19Q9UMS4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF19Q9UMS4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF19Q9UMS4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms