Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN11Q9UMQ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms