Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPCN1Q9ULQ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TPCN1Q9ULQ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
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