Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDRG4Q9ULP0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDRG4Q9ULP0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDRG4Q9ULP0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms