Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MED23Q9ULK4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MED23Q9ULK4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MED23Q9ULK4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms