Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKLN1Q9UL63 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKLN1Q9UL63 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms