Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD2Q9UKL4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms