Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO3Q9UK99 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FBXO3Q9UK99 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO3Q9UK99 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO3Q9UK99 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO3Q9UK99 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO3Q9UK99 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO3Q9UK99 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO3Q9UK99 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO3Q9UK99 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO3Q9UK99 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FBXO3Q9UK99 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms