Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO3A1Q9UIG8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLCO3A1Q9UIG8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLCO3A1Q9UIG8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms