Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPA4Q9UI42 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPA4Q9UI42 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms