Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMPXQ9UHP9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPXQ9UHP9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPXQ9UHP9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms