Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX20Q9UHI6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DDX20Q9UHI6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX20Q9UHI6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX20Q9UHI6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms