Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHORDC1Q9UHD1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHORDC1Q9UHD1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHORDC1Q9UHD1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms