Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3BQ9UH17 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms