Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT8Q9UFF9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNOT8Q9UFF9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT8Q9UFF9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms