Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFC0

LRWD1, Leucine-rich repeat and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRWD1Q9UFC0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRWD1Q9UFC0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRWD1Q9UFC0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRWD1Q9UFC0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms