Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRODH2Q9UF12 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRODH2Q9UF12 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms