Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXF1Q9UBU9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms