Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT3BQ9UBC3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3BQ9UBC3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms