Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C6orf48Q9UBA6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C6orf48Q9UBA6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms