Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSMC3IPQ9P2W1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMC3IPQ9P2W1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMC3IPQ9P2W1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms