Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A7Q9P2U7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms