Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHPF2Q9P2E5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CHPF2Q9P2E5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms