Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGFRNQ9P2B2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGFRNQ9P2B2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGFRNQ9P2B2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms